АО «Завод ПРОТОН» организован в 2004 году на базе Экспериментального завода «Протон» Московского института электронной техники, который начиная с 1978 - 1982 годов прочно утвердился, как один из лучших производственных коллективов Министерства образования СССР.
В настоящее время АО «Завод ПРОТОН» представляет современное, высокотехнологичное производство, оснащённое высоко автоматизированным технологическим оборудованием и поточными линиями.
Основным направлением деятельности «Завода ПРОТОН», как и в прошлые годы, остаётся металлообработка, изготовление вычислительной техники, электронных узлов и блоков как для гражданского назначения, так и в интересах Министерства обороны РФ.
Размещение МИЭТ(ТУ) и завода «ПРОТОН» в г. Зеленограде – центре Российской микроэлектроники, создает дополнительные возможности для создания самой совершенной микроэлектронной аппаратуры, средств вычислительной техники и систем управления, что уже давно привлекло внимание разработчиков В и ВТ к творческим коллективам научно-исследовательской части (НИЧ) МИЭТ(ТУ).
Производство завода размещено на 6000 кв.м производственных площадей и включает 3 основных цеха, 1 вспомогательный цех и участок.